по реальной проблеме: обратите внимание на $nav_xsl[$nav:nav_top_xsl.documentElement] Что вы добавляете в корень $document_tr?
по идеалистической проблеме: на кой черт вам весь этот лес? вам не жаль пользователя, который как дурак сидит и ждет пока ваш мега engine подключит полтос xsl'eй?
